Tặng thưởng

Ông được Nhà nước Việt Nam tặng thưởng:

• Huân chương Sao Vàng (truy tặng năm 2003).[3]
• Huân chương Độc lập hạng nhất.
• Huân chương Quân công hạng nhì.
• Huân chương Chiến thắng hạng nhất.

Tôn vinh

Sau khi ông mất, để tưởng nhớ ông, tháng 7 năm 1956, Bưu điện Việt Nam Dân chủ Cộng hòa đã phát hành một bộ tem gồm 4 mẫu in hình chân dung của ông. Ngoài ra, tên của ông được đặt cho:

• Một con đường ở Thành phố Hà Nội.
• Một con đường và một phường ở thành phố Nam Định và một đường ở thành phố Điện Biên Phủ, tỉnh Điện Biên.
• Trường THCS của thành phố Nam Định, thành phố Hà Nội và trường Phổ thông Trung học của huyện Ứng Hòa tại xã Hoa Sơn, huyện Ứng Hòa được mang tên Trần Đăng Ninh.
• Tại khu đất của gia đình thôn Quảng Nguyên, xã Quảng Phú Cầu, huyện Ứng Hòa quê hương ông, vào năm 2003 đã xây dựng Khu lưu niệm Trần Đăng Ninh.